在迷失岛2：时间的灰烬中，种子的获取并非直接拾取，而是需要玩家通过一系列关键步骤制作出来。种子是通过在工厂的特定装置中处理化石蛋而获得的，这是推动游戏核心时间穿越剧情的必备道具之一。要完成这一过程，玩家需要先修复工厂的线路，并将化石蛋放置在操作台上启动开关将其压碎，最终才能得到这粒至关重要的种子。
获取种子的前提是得到化石蛋这个原材料。化石蛋位于轮船的甲板上，需要玩家与一位穿着西装的男性角色进行互动才能获得。在此之前，玩家需要先取得一件名为蓝色羽毛的特殊道具，并将它交给这位西装男，作为交换，他会将化石蛋交给你。蓝色羽毛是解锁化石蛋进而获得种子的关键前置物品。
当玩家登上轮船后，需要找到并进入二楼的某个房间，在那里可以发现一个八音盒。与这个八音盒互动后，便能够从中取得蓝色羽毛，同时还会获得一支铅笔并记录下一段乐谱信息，这段乐谱在后续解谜中也有其用途。这是获取蓝色羽毛的标准路径。
在成功压碎化石蛋获得种子后，这件道具的用途便显现出来。玩家需要利用游戏中的时光机器回到过去的时空，将这粒种子交给位于海边场景的一名小男孩。完成这个交付动作后，再返回现在的时空，你会发现种子已经长成了一棵参天大树，这棵大树将成为你前往最终场景飞船的重要通道。
这个过程整合了游戏多个场景的探索与道具交换逻辑，是理解游戏时间叙事与推进主线进程的核心环节之一。
